[PHP] Poprawny wygląd strony, Funkcją include? Opcje

[Buła]

Witam.
Tworzę właśnie stronę internetową i zaczynam się zastanawiać, czy w ogóle dobrze się za to zabrałem.
Stronkę robie z PHP i mySQL, i wygląda to tak że mam pliki header.php i footer.php i w każdej podstronie includuje je.
Header kończy się po rozpoczęciu <div>, a footer zaczyna się na zakończeniu </div>.

Kod

<?
include("header.php");

Treść strony
  
include("footer.php");
?>

Czy takim sposobem łączy się zazwyczaj stronę w całość?
Jeśli nie tak, to proszę o rady, jak powinno to poprawnie wyglądać.

Patrzyłem na inne CMS, np Fussion i tam dali wszystko do maincore.php który includują w każdym pliku...
A w maincore.php znowu jest tone kodu którego do końca nie rozumiem i nie wiem co odpowiada np. za to, w którym miejscu wyświetli się nasza treść...

Proszę o rady