Czy istnieje sposób by wyeksportowany za pomocą myphpadmin plik .sql zawierający strukturę bazy zaimportować i uruchomić poprzez PHP
bez wprowadzania zmian w formacie pliku .sql ? Jeżeli tak to proszę o przykłada lub podpowiedź, jak to zrobić

Tak, exec lub multi_query

przykłady: https://stackoverflow.com/questions/1975135...abase-using-php