instaluję pakiet w phpstorm:

czy on nie powinien się znaleźć w composer.json? bo go nie widzę. Mam go ręcznie wpisywać czy jak?

[PHP] pobierz, plaintext 
    "require": {
        "php": ">=5.3.3",
        "symfony/symfony": "2.8.*",
        "doctrine/orm": "~2.2,>=2.2.3",
        "doctrine/doctrine-bundle": "~1.2",
        "twig/extensions": "~1.0",
        "symfony/assetic-bundle": "~2.3",
        "symfony/swiftmailer-bundle": "~2.3",
        "symfony/monolog-bundle": "~2.4",
        "sensio/distribution-bundle": "~3.0",
        "sensio/framework-extra-bundle": "~3.0",
        "incenteev/composer-parameter-handler": "~2.0",
        "doctrine/doctrine-fixtures-bundle": "2.2.*",
        "stof/doctrine-extensions-bundle": "~1.1@dev",
        "friendsofsymfony/user-bundle": "~2.0@dev",
        "friendsofsymfony/jsrouting-bundle": "~1.5",
        "knplabs/knp-paginator-bundle": "~2.4",
        "doctrine/annotations": "^1.2",
        "sonata-project/doctrine-orm-admin-bundle": "4.x-dev"
    },
[PHP] pobierz, plaintext 

Od jakiegoś czasu instalowałem w taki sposób pakiety, i wychodzi na to, że ich nie ma w composer.json. Oczywiście nie pamiętam jakie to pakiety były, czy mogę wygenerować plik composer.jon na podstawie zainstalowanych w projekcie pakietów, by móc odtworzyć projekt na innym komputerze? (czy to composer.lock za to odpowiada?)

composer.lock zawiera informacje o konkretnych wersjach zainstalowanych w projekcie. Na jego podstawie robiąc "composer install" pobierze konkretne wersje pakietów a nie najnowsze.

Zobacz czy nie masz gdzieś indziej composer.json.

i co masz w settings w tym okienku ?

-nie ma innego composer.json
-w settings jest Command lie parameters: "-n --no-progress"

composer odpalam w phpstorm z menu kontekstowego projektu i
composer->add dependency

(W ustawieniach phpstorm ścieżka dla composer.json też podana do pliku którego zawartośc wkleiłem wcześniej.)

Tak, PHPStorm sam aktualizuje ten plik po poprawnej instalacji.

Sprawdź dwie rzeczy:
1. Czy nie masz przypadkiem pliku otwartego i PHPStorm go nie odświeżył w tle. Czyli zamknij go i po zakończonej aktualizacji otwórz ponownie.
2. Zajrzyj do logu działania composera, czy na pewno się zainstalowało, czy nie było błędów etc.